Как правильно организовать обучение сотрудников аптеки и нужно ли оформлять протоколы? В какой форме они должны быть?

Нормативная документация по НАП и НДП не регламентирует форму проведения первичного и последующих инструктажей. Поэтому можно в Приказе «Об утверждении плана-графика первичной и последующей подготовки (инструктажа) работников» определить форму проведения инструктажей, или указать в отдельной колонке в Плане- графике (предпочтительнее, т.к. можно комбинировать форму).

Форма проведения инструктажей может быть очная, в виде лекции (инструктажа) или самостоятельная (например, индивидуальное изучение СОПов). Можно подготовить текстовые инструкции (наподобие инструкций по охране труда) и выдавать их для самостоятельного изучения (например, по актуальной нормативной документации).

Факт проведения инструктажа обязательно фиксируется в Журнале проведения инструктажа (наподобие Журнала по охране труда), с подписью сотрудника и ответственного специалиста за инструктаж.
Если организация проводит внутренний экзамен (аттестацию) сотрудников по результатам проведения инструктажей, то в этом случае нужно оформлять результаты Протоколом. Но эта инициатива - самой организации, нормативных требований к проведению экзаменов и протоколированию результатов нет.