Вопрос о различиях между СОП и Инструкцией

Ответ:

Инструкция является частным случаем выполнения какого-то процесса, когда требуется детально прописать технологию выполнения работы ответственным лицом. СОП (стандартная операционная процедура) определяет системный подход к выполнению процесса, которые включены в процессы НАП (НДП).

Т. е. СОП регламентирует процесс (хранение, реализацию и т. п.), а инструкция уточняет или дополняет выполнение требований СОП.